Konya'da doğdu; doğum tarihi bilinmiyor. Küçük yaşlarda hafız oldu . Biraz mûsikî öğrendikten sonra İstanbul'a gelerek önce Galata Mevlevîhânesi'ne girdi. Mûsikî sanatında ve ney üflemekte asıl ilerlemesi bu dergâhta oldu ve neyzenbaşılığa kadar yükseldi. Aynı zamanda iyi Çeng çalardı. O yüzden çengi lakabıyla anılırdı.
Sultan IV. Murad bir gün İstavroz Bahçesinde bulunurken, Mûsikî icrâ ediliyordu. Ney çalışındaki ustalığına hayran olan pâdişâh şeyhinin izni ile saraya alınmasını emretti. Böylece şeyhinin izni ve mevlevî elbisesi giymek şartı ile sarayın "Gılmanan-ı Hassa" sınıfına girdi.
Sultan IV. Murad'ın 1639 yılında ölümü üzerine saraydan istemeyerek ayrıldı. Bu sıralarda bütün eşyası yağmalanmıştı. Bunun üzerine küçük bir emeklilik maaşıyla hayatının bundan sonraki yıllarını Beşiktaş Mevlevîhânesi'nde geçirdi. Yusuf Dede 1669 yılında İstanbul'da vefat etti.
Neyzenin elimizde bulunan tek eseri Hüseynî makamındaki peşrevidir.